Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RCE1Q9Y256 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms