Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms