Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IGSF9BQ9UPX0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IGSF9BQ9UPX0 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
IGSF9BQ9UPX0 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.88
IGSF9BQ9UPX0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IGSF9BQ9UPX0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IGSF9BQ9UPX0 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IGSF9BQ9UPX0 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IGSF9BQ9UPX0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
IGSF9BQ9UPX0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IGSF9BQ9UPX0 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IGSF9BQ9UPX0 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IGSF9BQ9UPX0 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IGSF9BQ9UPX0 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IGSF9BQ9UPX0 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IGSF9BQ9UPX0 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IGSF9BQ9UPX0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IGSF9BQ9UPX0 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
IGSF9BQ9UPX0 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IGSF9BQ9UPX0 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
IGSF9BQ9UPX0 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IGSF9BQ9UPX0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
IGSF9BQ9UPX0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IGSF9BQ9UPX0 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IGSF9BQ9UPX0 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IGSF9BQ9UPX0 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IGSF9BQ9UPX0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IGSF9BQ9UPX0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IGSF9BQ9UPX0 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IGSF9BQ9UPX0 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IGSF9BQ9UPX0 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IGSF9BQ9UPX0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IGSF9BQ9UPX0 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IGSF9BQ9UPX0 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IGSF9BQ9UPX0 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IGSF9BQ9UPX0 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IGSF9BQ9UPX0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IGSF9BQ9UPX0 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IGSF9BQ9UPX0 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms