Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC12A4Q9UP95 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SLC12A4Q9UP95 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms