Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX6Q9UNH7 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX6Q9UNH7 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX6Q9UNH7 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX6Q9UNH7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX6Q9UNH7 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX6Q9UNH7 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX6Q9UNH7 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX6Q9UNH7 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX6Q9UNH7 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX6Q9UNH7 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX6Q9UNH7 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX6Q9UNH7 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX6Q9UNH7 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX6Q9UNH7 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX6Q9UNH7 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX6Q9UNH7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX6Q9UNH7 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX6Q9UNH7 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX6Q9UNH7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX6Q9UNH7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX6Q9UNH7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX6Q9UNH7 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX6Q9UNH7 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX6Q9UNH7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX6Q9UNH7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX6Q9UNH7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX6Q9UNH7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX6Q9UNH7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX6Q9UNH7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX6Q9UNH7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX6Q9UNH7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX6Q9UNH7 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX6Q9UNH7 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX6Q9UNH7 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX6Q9UNH7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX6Q9UNH7 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX6Q9UNH7 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX6Q9UNH7 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms