Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms