Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms