Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms