Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK99

FBXO3, F-box only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO3Q9UK99 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 AC084866.2-201ENST00000509956 449 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO3Q9UK99 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO3Q9UK99 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO3Q9UK99 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO3Q9UK99 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO3Q9UK99 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO3Q9UK99 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO3Q9UK99 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO3Q9UK99 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO3Q9UK99 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO3Q9UK99 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO3Q9UK99 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO3Q9UK99 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO3Q9UK99 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO3Q9UK99 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO3Q9UK99 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO3Q9UK99 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO3Q9UK99 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO3Q9UK99 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO3Q9UK99 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO3Q9UK99 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO3Q9UK99 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO3Q9UK99 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO3Q9UK99 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO3Q9UK99 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO3Q9UK99 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO3Q9UK99 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO3Q9UK99 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO3Q9UK99 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO3Q9UK99 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO3Q9UK99 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO3Q9UK99 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO3Q9UK99 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO3Q9UK99 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO3Q9UK99 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO3Q9UK99 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO3Q9UK99 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO3Q9UK99 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO3Q9UK99 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO3Q9UK99 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO3Q9UK99 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO3Q9UK99 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO3Q9UK99 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO3Q9UK99 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO3Q9UK99 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO3Q9UK99 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO3Q9UK99 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO3Q9UK99 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO3Q9UK99 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO3Q9UK99 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO3Q9UK99 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO3Q9UK99 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO3Q9UK99 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO3Q9UK99 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO3Q9UK99 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms