Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MBD1Q9UIS9 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MBD1Q9UIS9 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MBD1Q9UIS9 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MBD1Q9UIS9 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MBD1Q9UIS9 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MBD1Q9UIS9 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MBD1Q9UIS9 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MBD1Q9UIS9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MBD1Q9UIS9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MBD1Q9UIS9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MBD1Q9UIS9 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MBD1Q9UIS9 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MBD1Q9UIS9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MBD1Q9UIS9 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MBD1Q9UIS9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MBD1Q9UIS9 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MBD1Q9UIS9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MBD1Q9UIS9 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MBD1Q9UIS9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MBD1Q9UIS9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MBD1Q9UIS9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MBD1Q9UIS9 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
MBD1Q9UIS9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MBD1Q9UIS9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MBD1Q9UIS9 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MBD1Q9UIS9 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MBD1Q9UIS9 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MBD1Q9UIS9 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MBD1Q9UIS9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MBD1Q9UIS9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MBD1Q9UIS9 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MBD1Q9UIS9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MBD1Q9UIS9 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MBD1Q9UIS9 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms