Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFT172Q9UG01 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC26■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC26■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC26■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms