Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM8A1Q9UBU6 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms