Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP2BPQ9P2M1 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms