Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1F3

ABRACL, Costars family protein ABRACL, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRACLQ9P1F3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABRACLQ9P1F3 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms