Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms