Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms