Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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HOXC10Q9NYD6 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXC10Q9NYD6 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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