Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms