Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXB0

MKS1, Meckel syndrome type 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1Q9NXB0 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKS1Q9NXB0 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms