Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DNAJC28Q9NX36 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms