Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GINM1Q9NU53 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms