Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMILIN3Q9NT22 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms