Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAMSN1Q9NSI8 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms