Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF275Q9NSD4 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms