Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TM7SF3Q9NS93 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms