Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LTBP3Q9NS15 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
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