Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms