Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms