Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCAF1Q9H7N4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCAF1Q9H7N4 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCAF1Q9H7N4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCAF1Q9H7N4 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCAF1Q9H7N4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCAF1Q9H7N4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCAF1Q9H7N4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCAF1Q9H7N4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCAF1Q9H7N4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCAF1Q9H7N4 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCAF1Q9H7N4 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCAF1Q9H7N4 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCAF1Q9H7N4 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCAF1Q9H7N4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCAF1Q9H7N4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCAF1Q9H7N4 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCAF1Q9H7N4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCAF1Q9H7N4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCAF1Q9H7N4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCAF1Q9H7N4 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCAF1Q9H7N4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCAF1Q9H7N4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCAF1Q9H7N4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCAF1Q9H7N4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCAF1Q9H7N4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCAF1Q9H7N4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCAF1Q9H7N4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCAF1Q9H7N4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCAF1Q9H7N4 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCAF1Q9H7N4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCAF1Q9H7N4 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCAF1Q9H7N4 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SCAF1Q9H7N4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCAF1Q9H7N4 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCAF1Q9H7N4 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCAF1Q9H7N4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCAF1Q9H7N4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCAF1Q9H7N4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCAF1Q9H7N4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCAF1Q9H7N4 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCAF1Q9H7N4 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCAF1Q9H7N4 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCAF1Q9H7N4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCAF1Q9H7N4 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SCAF1Q9H7N4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SCAF1Q9H7N4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SCAF1Q9H7N4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SCAF1Q9H7N4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SCAF1Q9H7N4 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SCAF1Q9H7N4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SCAF1Q9H7N4 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SCAF1Q9H7N4 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
SCAF1Q9H7N4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SCAF1Q9H7N4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SCAF1Q9H7N4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SCAF1Q9H7N4 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SCAF1Q9H7N4 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SCAF1Q9H7N4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SCAF1Q9H7N4 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms