Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms