Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU1

MCOLN1, Mucolipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN1Q9GZU1 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MCOLN1Q9GZU1 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms