Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHE41Q9C0J9 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms