Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
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