Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM4Q9C037 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms