Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms