Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms