Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CELF4Q9BZC1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CELF4Q9BZC1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CELF4Q9BZC1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CELF4Q9BZC1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CELF4Q9BZC1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CELF4Q9BZC1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CELF4Q9BZC1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CELF4Q9BZC1 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CELF4Q9BZC1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CELF4Q9BZC1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CELF4Q9BZC1 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CELF4Q9BZC1 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CELF4Q9BZC1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CELF4Q9BZC1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CELF4Q9BZC1 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CELF4Q9BZC1 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CELF4Q9BZC1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CELF4Q9BZC1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CELF4Q9BZC1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CELF4Q9BZC1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CELF4Q9BZC1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CELF4Q9BZC1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CELF4Q9BZC1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CELF4Q9BZC1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CELF4Q9BZC1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CELF4Q9BZC1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CELF4Q9BZC1 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CELF4Q9BZC1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CELF4Q9BZC1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CELF4Q9BZC1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CELF4Q9BZC1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CELF4Q9BZC1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CELF4Q9BZC1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CELF4Q9BZC1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CELF4Q9BZC1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CELF4Q9BZC1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CELF4Q9BZC1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CELF4Q9BZC1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CELF4Q9BZC1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CELF4Q9BZC1 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CELF4Q9BZC1 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CELF4Q9BZC1 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CELF4Q9BZC1 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CELF4Q9BZC1 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CELF4Q9BZC1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CELF4Q9BZC1 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CELF4Q9BZC1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CELF4Q9BZC1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CELF4Q9BZC1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CELF4Q9BZC1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CELF4Q9BZC1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CELF4Q9BZC1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CELF4Q9BZC1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CELF4Q9BZC1 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CELF4Q9BZC1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CELF4Q9BZC1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CELF4Q9BZC1 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CELF4Q9BZC1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CELF4Q9BZC1 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CELF4Q9BZC1 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CELF4Q9BZC1 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CELF4Q9BZC1 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CELF4Q9BZC1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CELF4Q9BZC1 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms