Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM54Q9BYV2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms