Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 RIMKLB-213ENST00000619374 1519 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009656.1-201ENST00000531966 478 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACYP1-204ENST00000555135 639 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHAC2-201ENST00000295304 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms