Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC01221-201ENST00000432488 662 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms