Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HDAC8Q9BY41 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms