Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRRTQ9BXP5 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SRRTQ9BXP5 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SRRTQ9BXP5 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SRRTQ9BXP5 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SRRTQ9BXP5 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SRRTQ9BXP5 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRRTQ9BXP5 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRRTQ9BXP5 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRRTQ9BXP5 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRRTQ9BXP5 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRRTQ9BXP5 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRRTQ9BXP5 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRRTQ9BXP5 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRRTQ9BXP5 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRRTQ9BXP5 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRRTQ9BXP5 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRRTQ9BXP5 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRRTQ9BXP5 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRRTQ9BXP5 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRRTQ9BXP5 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRRTQ9BXP5 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SRRTQ9BXP5 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRRTQ9BXP5 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRRTQ9BXP5 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRRTQ9BXP5 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRRTQ9BXP5 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms