Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms