Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SALL3Q9BXA9 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms