Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms