Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf16Q9BUW7 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms