Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PAGR1Q9BTK6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms