Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms