Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLF1Q9BQI6 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms