Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SGIP1Q9BQI5 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms